Borgundaberget är ett typiskt platåberg, som kännetecknas av ett antal olika kambrosiluriska lager med ett skyddande diabaslager högst upp. Själva platån är så gott som helt plan och markeras av mindre stup och kraftiga sluttningar åt väster, norr och öster. Platån är klädd med gammal lövskog som hyser en mycket stor förekomst av död ved. Björk, asp och sälg dominerar, men även gran, oxel, fågelbär, ask, ek, rönn, tall, alm, och vildapel förekommer. Här finns en mycket rik vedsvampflora med flera rödlistade arter som är knutna till den naturligt döda veden. Hassel förekommer rikligt i större delen av området.
Branterna är blockrika med höga naturvärden knutna till skogsmiljön med dess bitvis åldriga trädskikt. I vissa delar av branterna översilas blocken ständigt av fukt och vatten, vilket resulterar i att tjocka mossfällar breder ut sig över stenar och trädbaser.